Voici comment j'utilise mes deux outils "Magneto" et "RoyPlayer" de façon complémentaire avec ma Freebox V4.
Magnéto est installé dans un VirtualHost de mon serveur Apache, serveur qui est donc allumé 24h/24. Le .htaccess est configuré de telle façon que j'y accède derrière le proxy de mon boulot, etc. Je peux donc programmer mes enregistrements n'importe quand et de n'importe où :-)
Le plugin Explorer de RoyPlayer est configuré afin de pointer par défaut dans le répertoire de Magnéto.
Comme mon serveur n'est pas une bête de course et qu'il a déjà beaucoup à faire avec son "petit" CPU, il est hors de question de transcoder les vidéos.
Les vidéos enregistrés par Magneto sont dans le format natif de la Freebox V4, il n'est donc pas utile de transcoder, on peut envoyer la vidéo telle quelle à la Freebox.
Je lance donc VLC comme ceci, sans les options de transcodage :

vlc --extraintf http --http-host :8081 --sout="#std" --sout-standard-access=udp --sout-standard-mux=ts --sout-standard-url=212.27.38.253:1234 --sout-ts-pid-video=68 --sout-ts-pid-audio=69 --sout-ts-pcr=80 --sout-ts-dts-delay=400 --color --play-and-stop --file-caching=1000

Bien sûr, il n'est alors plus possible de lire d'autres formats (Xvid, DivX, etc) avec RoyPlayer.
Il reste encore des améliorations possibles, notamment un plugin RoyPlayer pour programmer directement Magnéto, pour qu'on puisse tout faire à la télécommande (presque comme sur une Freebox V5).